有機多孔材料具有有序的微孔結構。POF的微孔結構可以通過材料對氮氣等分子作為探針的吸附行為的測試來研究。研究顯示,POF一般具有尺寸分布很小的微孔結構,也側面說明了POF結構微觀尺寸上的規則性。而有序單一的微孔結構對于氣體存儲、小分子分離、催化劑等的擔載以及主客體化學的應用和研究都有很大的意義。
有機多孔材料的內表面積很大。材料的內表面積也是通過氮氣等分子作為探針來測試的,可以一定程度上衡量多孔材料吸附小分子的能力。POF材料的內表面積通常在每克1000平方米以上,高于傳統的微孔材料沸石分子篩。而PAF-1的內表面積達到每克5600平方米,甚至可以和晶態微孔材料MOF中的媲美。